La historia comienza con un enfrentamiento entre dos héroes rivales ZET y ALPHAS y luego rastrea sus orígenes: Jin Kanzaki un joven con la habilidad de transformarse en un ser sobrehumano conocido como ZET y Kouga Amagi un joven con un fuerte sentido de la justicia que utiliza la tecnología para luchar como ALPHAS.
Los destinos de estos dos hombres y de quienes los rodean se entrelazan mientras luchan por proteger a la humanidad y destruir monstruosas abominaciones conocidas como Jugadores.
