Durante un intento impulsivo de salvar a su padre y a su moribundo planeta natal de Eltria, Kyrie Florian es traicionada por su amiga de la infancia, Iris. Además, el poder que Kyrie ha reunido de Nanoha Takamachi y los otros protectores de la Tierra no puede ser utilizado para ayudar a su padre.
Iris deja de lado a la desesperada Kyrie, habiendo adquirido lo que deseaba para vengarse de Yuri Eberwein, un poderoso ser que yace dormido en la Tierra. Sola para recoger las piezas, Nanoha y sus aliados deben confrontar a la problemática Iris para descubrir la verdad y detener el conflicto entre ella y Yuri.
Sin embargo, en medio de las batallas furiosas, una amenaza mucho más peligrosa acecha en las sombras. No importa el obstáculo, Nanoha se mantiene diligente y no duda en ayudar a los necesitados con su magia.
